VASP编译与安装

1. 安装Intel依赖库

  • 安装步骤略，可在任意网站搜索到，之后需要将intel加入到环境变量中，如下：

nano ~/.bashrc

填入以下内容：

source /opt/intel/intel-2018up4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/mkl/bin/mklvars.sh intel64 && \
source /opt/intel/intel-2018up4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/bin/ifortvars.sh intel64 && \
source /opt/intel/intel-2018up4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/bin/iccvars.sh intel64 && \
source /opt/intel/intel-2018up4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/mpi/intel64/bin/mpivars.sh intel64

  • 保存退出后，执行以下命令使环境变量生效：

source ~/.bashrc

  • 然后进入/opt/intel/intel-2018up4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/mkl/interfaces/fftw3xf，运行make libintel64命令，过一会儿当前目录下会产生libfftw3xf_intel.a库文件。

2. 编译 VASP

  • 首先准备安装包，下载地址：https://www.vasp.at/index.php/download （地址不对，商业软件请尊重版权）

  • 解压安装包：

tar -xvf vasp.6.1.0.tar.gz

  • 进入解压后的文件夹:

cd vasp.6.1.0

  • 执行：

cp arch/makefile.include.linux_intel ./makefile.include

  • 打开此文件，把其中的OFLAG参数里加入-xhost，这样编译器会使得编译出的程序能够利用当前机子CPU能支持的最高档次的指令集以加速计算，也因此就没必要手动添加其它一些VASP编译教程里诸如-xAVX、-mSSE4.2之类的选项了。

  • 可选操作：修改makefile文件，将其中的

#FFTW_INC = -I$(MKLROOT)/include
#FFTW_LIB = -L$(MKLROOT)/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core

改为

FFTW_INC = -I/opt/intel/intel-2018up4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/mkl/interfaces/fftw3xf
FFTW_LIB = -L/opt/intel/intel-2018up4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/mkl/interfaces/fftw3xf -lfftw3xf_intel

  • 注意: 如果你的机器以及以后的计算不涉及GPU加速，则将makefile.include文件开头修改为：

VERSIONS = std gam ncl
#VERSIONS = std gam ncl gpu gpu_ncl

打开makefile.include文件，将其中的

OFLAG      = -O2

改为：

OFLAG      = -O2 -xhost

  • 然后开始编译：

make all #约半小时

  • 编译成功后会在当前目录的bin目录下生成vasp_std等文件

  • 最后在~/.bashrc文件中添加以下内容：

nano ~/.bashrc

export VASP_HOME=/opt/apps/vasp.6.1.0 && \
export PATH=$VASP_HOME/bin:$PATH

  • 保存退出后，执行以下命令使环境变量生效：

source ~/.bashrc

  • 注意: 可以在~/.bashrc文件中添加以下内容，使得每次使用vasp命令即可替代vasp_std：

alias vasp='/opt/apps/vasp.6.1.0/bin/vasp_std'

注意事项： 在AMD的机子上使用Intel 2020编译器编译VASP时，会出现错误。尽量使用其他版本的编译器。