常用的量化可视化工具

注:仅罗列好用的数款用于量化分析及绘图。

  1. Multiwfn:完全免费。对几乎所有的量化软件及程序都有较好的支持,可观看轨道和结构,是强大的分析波函数的工具。不能编辑结构。软件下载地址

  2. GaussView:付费但值得购买。分子体系建模是所有可视化软件中最出色的,堪称完美。图像显示效果平庸。对Gaussian支持完美。

  3. GaussSum:GaussSum是图形用户界面,可用于分析ADFGAMESS(US)GAMESS-UKGaussian,和PC-GAMESS的输出,提取和计算有用的信息,包括SCF循环过程,结构优化,UV-Vis/IR/Raman光谱,能级,MO贡献等。软件下载地址

  4. VESTA:免费。主要用于晶体可视化(VASP、CP2K软件必备后处理),以及可视化第一性原理程序给出的格点数据文件。软件下载地址

  5. VMD:完全免费。基本不能编辑结构。可视化效果极好,界面设计绝佳,使用超级灵活,对生物分子有较好支持,可用于Gmx软件的后处理,支持大多数输出文件。软件下载地址

  6. Chem3D:收费。虽然可以编辑结构,但是相对不好用,显示效果较差。但有不少辅助功能,可用与对分子结构进行初优,作为Gaussian计算的初始结构。软件下载地址。绝大多数建模使用M$2020软件,这里不做过多介绍。

  7. ChemCraft:收费。支持显示的风格很多,且可以充分自定义。可以用于简单的分子建模。可以加载许多量化程序输出文件观看结果。附带一些零碎的结构分析处理功能。和 7提到的软件功能相近。软件下载地址

  8. Avogadro:免费。可以观看分子和晶体以及进行建模,可以加载许多量化程序输出文件观看结果,可以生成一些计算化学程序输入文件。界面设计不好,win下容易崩溃。软件下载地址

  9. CYLView:免费。功能少,最大亮点是可视化效果很出色,可以很容易地实现效果很好的背景虚化和景深效果。绘制较好看的分子模型时推荐使用该软件。操作指南:使用CYLview绘制高质量分子结构图和制作化学反应演示动画 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)软件下载地址效果如下:1704876288076

  10. CrystalMakerCrystalMaker Software: Crystal & Molecular Structures Modelling and Diffraction

  11. Diamond 4Diamond - Crystal and Molecular Structure Visualization (crystalimpact.com)

  12. Nanotube ModelerNanotube Modeler (Nanocones, Bucky-Ball, Fullerenes, Simulation Software) (jcrystal.com)

  13. Open BabelOpen Babel - the chemistry toolbox — Open Babel openbabel-3-1-1 documentation基于OpenBabel批量产生特定基团以任意方式接到苯上的结构的方法

  14. P4VASPp4vasp.at | P4VASP (testednet.com)